南京農業大學以科技創新支撐高質量發展，不斷提升高校服務科技原始創新能力，推動高水平科技自立自強。

扎根基礎研究，堅持創新引領。學校深入解析農業生命科學的現象、原理、機制等，強化原始創新能力，持續提升基礎研究水平。突破秈粳雜種優勢利用難的瓶頸，為進一步挖掘作物高產優質基因提供理論支撐。實施農業生物全基因組編輯、農業生物“干細胞”、作物表型大科學等計劃，推動農業科技領域“迭代式”關鍵研究，突破農業科技前沿“無人區”。

服務鄉村振興，推動共同富裕。學校聚焦科技創新團隊、科技成果轉移轉化，深耕“三農”事業“主戰場”，高質量服務國家鄉村振興戰略。菊花遺傳與種質創新團隊依托菊花種質資源在全國20余個省市打造 “菊花海”，提升所在地的旅游綜合效益。土壤微生物與有機肥團隊圍繞有機肥產業所需與發展所向，開展農業固體廢棄物肥料化利用、土壤結構改善、作物品質提升等技術研發與示范推廣，為我國經濟作物產業健康發展做出重大貢獻。學校定點幫扶貴州麻江，依托優勢學科成立10支產業技術專班，服務麻江10個產業，用金牌學科、鑄招牌產業、創品牌產品，打造麻江鄉村產業“特色路”。