南京醫科大學將新時代黨建理論融入傳統德育系統，用 “黨建+”模式，將黨建與教育教學管理有機結合，實施“思想引領紅心工程、典型引導暖心工程、榜樣引路匠心工程、文化引航修心工程”，形成“九位一體”全員育人格局，構建了“大思政”格局下新時代育人體系。

聚合育人資源。建立“黨委統一領導、部門分工負責、全員協同參與”的責任體系，將育人貫穿思想理論、學科教學、日常教育、管理服務、安全穩定、隊伍建設、評估督導等七方面。聘任“抗疫英雄”“國之名醫”擔任思想政治理論課兼職教授；實施“家長觀察員”“校友進校園”制度，建立“成長導師”制，形成“九位一體”全員育人格局。

遵循育人規律。用活第一課堂、充實第二課堂、完善校外課堂。建強馬克思主義學院，實施思政工作質量提升工程，組建課程思政教學團隊，實施思政課教學名師培育計劃，打造一批思政“金課”。開展“應急救護普及宣傳”等特色項目，創辦形式多樣的“行走課堂”。

創新育人機制。堅持“五育并舉”，以德善講堂、成長導師工作坊等載體，實現以德育揚善；實施本科教育振興計劃，改革課堂教育，實現以智育啟真；實施體育教育教學改革，打造競技體育特色項目，實現以體育強身；厚植優秀傳統文化，開展校園讀書月、“高雅藝術進校園”等品牌活動，實現以美育塑心；通過拓荒藥用植物園、“三下鄉”暑期實踐等活動，實現以勞育立行。